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AMCoR:Asahikawa Medical University Collection and Research (旭川医科大学学術成果リポジトリ)は、本学で生産された電子的な知的生産物(学術雑誌論文の原稿・教材・学術資料など)を保存し、原則的に無償で発信するためのインターネット上の保管庫です。

※AMCoRに収録された学術論文のほとんどは、商業出版社や学会出版社の学術雑誌に掲載されたものですが、著作権に係わる出版社の方針により、出版社の条件に添った版を収録しています。そのため実際の誌面とはレイアウトの相違や、字句校正による文言の違いがあり得ますことをあらかじめご了承ください。


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ID 20210325_K555
アイテムタイプ Article
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本文 K555 Okada Testuhiro_TD.pdf
Type : application/pdf Download
Size : 11.5 MB
Last updated : Nov 4, 2021
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タイトル Digiral PCR-based plasma cell-free DNA mutation analysis for early-stage pancreatic tumor diagnosis and surveillance (デジタルPCRを用いた遺伝子変異解析による膵腫瘍の早期診断とサーベイランス)
著者
岡田, 哲弘 (Okada, Tetsuhiro)
上位タイトル
Journal of gastroenterology Vol.55, No.12  (2020. 12) ,p.1183- 1193
識別番号
ISSN
0944-1174
DOI 10.1007/s00535-020-01724-5
博士論文情報
学位授与番号 10107A555
学位授与年月日 2021-03-25
学位名 博士(医学)
学位授与機関 旭川医科大学
抄録 Background: Cell-free DNA (cfDNA) shed from tumors into the circulation offers a tool for cancer detection. Here, we evaluated the feasibility of cfDNA measurement and utility of digital PCR (dPCR)-based assays, which reduce subsampling error, for diagnosing pancreatic ductal adenocarcinoma (PDA) and surveillance of intraductal papillary mucinous neoplasm (IPMN).

Methods: We collected plasma from seven institutions for cfDNA measurements. Hot-spot mutations in KRAS and GNAS in the cfDNA from patients with PDA (n = 96), undergoing surveillance for IPMN (n = 112), and normal controls (n = 76) were evaluated using pre-amplification dPCR.

Results: Upon Qubit measurement and copy number assessment of hemoglobin-subunit (HBB) and mitochondrially encoded NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit 1 (MT-ND1) in plasma cfDNA, HBB offered the best resolution between patients with PDA relative to healthy subjects [area under the curve (AUC) 0.862], whereas MT-ND1 revealed significant differences between IPMN and controls (AUC 0.851). DPCR utilizing pre-amplification cfDNA afforded accurate tumor-derived mutant KRAS detection in plasma in resectable PDA (AUC 0.861-0.876) and improved post-resection recurrence prediction [hazard ratio (HR) 3.179, 95% confidence interval (CI) 1.025-9.859] over that for the marker CA19-9 (HR 1.464; 95% CI 0.674-3.181). Capturing KRAS and GNAS could also provide genetic evidence in patients with IPMN-associated PDA and undergoing pancreatic surveillance.

Conclusions: Plasma cfDNA quantification by distinct measurements is useful to predict tumor burden. Through appropriate methods, dPCR-mediated mutation detection in patients with localized PDA and IPMN likely to progress to invasive carcinoma is feasible and complements conventional biomarkers.
キーワード
Cell-free DNA
Digital PCR
Liquid biopsy
Pancreatic cancer
Risk assessment
言語
eng
資源タイプ application/pdf
ジャンル Thesis or Dissertation
著者版フラグ ETD
Index
/ Public
/ Public / 学位論文
/ Public / 学位論文 / 博士論文2020.3~
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