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AMCoR:Asahikawa Medical University Collection and Research (旭川医科大学学術成果リポジトリ)は、本学で生産された電子的な知的生産物(学術雑誌論文の原稿・教材・学術資料など)を保存し、原則的に無償で発信するためのインターネット上の保管庫です。

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タイトル Species identification and strain typing of dermatophytes by single-strand conformation polymorphism (SSCP) analysis of the ribosomal DNA and polymerase chain reaction analysis of subrepeat elements in the intergenic spacer region of Trichophyton rubrum
著者
Takahashi, Ichiro
Fukushima, Kazutaka
Miyaji, Makoto
Nishimura, Kazuko
Asano, Kazuhiro
Iizuka, Hajime
上位タイトル
旭川医科大学研究フォーラム Vol.15, No.1  (2015. 2) ,p.27- 36
識別番号
ISSN
1346-0102
抄録 The PCR-single strand conformation polymorphism (PCR-SSCP) analysis is a rapid and convenient technique for
the detection of mutations and allelic variants. We applied this technique for the identification of various dermatophyte
species. We also examined genetic polymorphisms in intra-species of 2 major dermatophytes, T. rubrum and T.
mentgrophytes var. interdigitale. The PCR products including internal transcribed spacer (ITS) 1 region of ribosomal DNA
(rDNA) of Trichophyton rubrum, T. mentagrophytes var. interdigitale, T. verrucosum, Microsporum canis, M. gypseum,
Epidermophyton floccosum were analyzed. Specific SSCP patterns for each species were obtained. This result indicated
that the system is useful for species identification. SSCP analysis of the amplified products from the posterior part of the
D1/D2 (5′ end domain of the 26S rDNA) regions manifested the presence of 2 distinctive types of T. mentagrophytes var.
interdigitale. The difference proved to be one nucleotide substitution, C → T. There was no clear correlation between
the genotype patterns and morphological phenotypes of this fungus. On the other hand, no intra-species polymorphism
was detected in T. rubrum by PCR-SSCP analysis using the region including ITS1, 5.8S rDNA, ITS2 and D1/D2, totally
spanning about 1.2 kbp. Subsequent PCR analysis of non-transcribed intergenic spacer (IGS) region of T. rubrum showed
the occurrence of numerous intra-species polymorphisms. The system should be useful for epidemiological surveillance of
dermatophyte infection and give us new insights into pathogenicity of dermatophyte species.
キーワード
Dermatophytes
Identification
SSCP
PCR
Polymorphism
注記 雑誌掲載版
言語
jpn
資源タイプ text
ジャンル Journal Article
著者版フラグ publisher
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